1、水质污染。由于温室蔬菜种植时节多在冬季,因此，供水水源完全依靠机井提灌。从机井到滴灌管，
滴灌系统的水源自然形成了二级供水，第一级是水泵出水口至蓄水池，第二级是温室调温水池至滴头。如果机井出水口没有沉砂设施,或沉砂池出水口较低水流冲击力使泥沙通过各级管道进入过滤器，引起过滤器和灌水器(以下简称滴头)产生淤泥堵塞；调温水池或管道中剩余的水不及时排出，日积月累，也容易擎生各种藻类，同样引起滴头堵塞。
2、材料性能不配套。滴灌系统是在一定的压力条件下，水流经供水管道系统进入首部,过滤器后的水直接由滴灌管网送到灌水器输入蔬菜根部。如果供水材料质量残次东拼西凑、配件性能不匹配、不符合国家规定的标准、承压能力差及使用寿命参差不齐等，容易引起管道破损，致使泥沙进入管道造成系统堵塞。
3、管道安装不规范。供水管道的安装质量直接影响着滴灌系统的正常运行。管件承插口(接头)安装不严谨、不密封不能抵抗水击、水锤压力引起的冲击、倒吸现象，基槽中的泥沙被吸入输水管道引起系统堵塞。
4、管网布置不合理。各级管道没有设置合理的纵坡冲洗泥沙和藻类效果不明显，容易积攒污垢，引起滴灌系统堵塞。
5、运行制度不科学。滴灌
系统没有进行经常的、定期的冲洗，基本指标没有达到设计值就投入使用，引起
滴灌系统堵塞。
